Бьякуган
Бьякуган - Наследственная черта клана Хюга, участвовавшего в создании деревни Скрытой Листвы и являющегося одним из самых уважаемых в этом селении. Представляет собой практически безликие белые глаза. Как и шаринган, бьякуган может быть пересажен другому ниндзя, примером чему является Ао из Селения Скрытого Тумана. Активированный бякуган даёт ниндзя обострённое чувство восприятия, он позволяет видеть сквозь различные препятствия и создаёт угол обзора практически в 360° (за исключением слепого пятна, находящегося в задней части шеи около третьего грудного позвонка). Также одной из особенностей бякугана является его дальнодействие.
Шаринган
Шаринган - Наследственная черта клана Учиха. Представляет сабой красную радужную оболочка, внутри глаза три знака в виде томоэ, образующие равносторонний треугольник, центром которого является зрачок. Такой сяринган во много раз улучшает реакцию его использующего. Кроме этого, позволяет предугадывать движения противников, а также с высокой эффективностью использовать гэндзюцу.
Риннэнган
Риннэнган - считается наиболее мощным из трёх великих додзюцу. Он представлен в виде нескольких концентрических кругов, расположенных на фиолетовом фоне. Считается, что ниндзя, обладающий риннэнганом может использовать все доступные разновидности техник (техники огня, воды, ветра, земли и молнии), что могло служить как целям созидания, так и целям разрушения. В детстве сирота из деревни Дождя, Нагато, являвшийся обладателем этого додзюцу, использовал риннэнган подсознательно когда был испуган или если ему угрожала опасность. Повзрослев, Нагато, также известный как Пэйн, стал одним из лидеров Акацуки. С помощью риннэнгана он мог перемещать свой разум в другие тела, что делало его практически неуязвимым.
Первым же обладателем риннэгана считается Рикудо Сэннин — первый в мире ниндзя. Он всегда изображается в виде тёмного силуэта, на шее которого висит ожерелье, состоящее из шести символов, олицетворяющих 6 видов использования чакры (6 путей):
Мир Богов — возможность управления гравитацией.
Мир Демонов — возможность манипулирования чакрой и модификацией тел.
Мир Людей — возможность чтения мыслей, просто положив руку на голову человека, а также мгновенного уничтожения человека путём разрыва его души.
Мир Животных — способность вызывать животных.
Мир Духов — способность поглощать энергию.
Мир Ада — способность воскрешать и восстанавливать повреждённые органы